تتلخص أهداف البحث فيما يلي:
أولا: العمل على تحصين فكر الفرد وعقله من الانحراف أو الخروج عن الوسطية والاعتدال عند التعامل في الحياة، لاسيّما القضايا الفكرية التي تشكل مصدر تهديد للأمن الفكري .
ثانيًا: تصحيح الفهم الخاطئ للمفاهيم الإسلامية وتوضيح المقاصد الشرعية منها، والعمل على تنمية قيم الانتماء والمواطنة لدى أفراد المجتمع.
ثالثًا: تفعيل دور الأسرة في تعزيز الأمن الفكري لدى أبنائها، وكذلك المؤسسات الدينية والتعليمية والإعلامية المختلفة لتحصين المجتمع ضد التأثر بالثقافات السلبية الوافدة.
رابعًا: تعزيز الأمن الفكري من خلال: مكافحة ما ينشر عبر وسائل الإعلام من انحرافات فكرية وعقدية، وإسناد مهمة الدعوة والإرشاد إلى دعاة وأئمة مؤهلين علميًّا وعمليًّا.
خامساً: معالجة ظاهرة الغلو والتطرف باعتبارهما من عوامل تنمية الانحراف الفكري.